东南大学：位于南京，历史悠久，工程类学科尤为突出。该校在建筑学、土木工程、交通运输等领域具有强大的教学和科研优势。同时，东南大学的计算机科学、电子信息等学科也有较好的声誉。
北京航空航天大学：位于北京，以航空航天为特色，尤其在航空航天工程、飞行器设计、航空动力等领域居于国内领先地位。北航在电子工程、计算机科学等领域也有显著优势，是国内顶尖的理工科院校之一。
两校的区别主要体现在学科特色上，东南大学更加注重综合性，尤其在城市建设、交通等领域有较强优势；而北京航空航天大学则侧重于航空航天及其相关领域，是该行业的翘楚。
其次更大的区别是城市的区别，一个是长三角，一个是北京，实习的机会不一样